Mathematical modelling of single-cell treatment resistance signatures by lineage tracing

Tutkimme projektissa syöpäsolujen lääkeresistenssiä yksisolu-RNA-sekvensoinnilla ja uudella ReSisTrace-linjajäljitysmenetelmällämme. Tavoitteena on tunnistaa haimasyövän lääkeresistenssiin liittyviä ekspressioprofiileja seuraamalla geenien ilmentymistä yksittäisissä soluissa lääkehoidon aikana. Käytämme laskennallisia malleja ennustaaksemme resistenssiä ehkäiseviä lääkeyhdistelmiä, joiden tehon vahvistamme syöpäorganoideissa. Hyödynnämme myös spatiaalista transkriptomiikkaa arvioidaksemme lääkeh